RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF521	Q96K83	1311 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	DGKI	O75912	1065 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FGB	P02675	491 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	CYBA	P13498	195 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	SERINC3	Q13530	473 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR78	Q5VTH9	848 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	RNF180	Q86T96	592 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PORCN	Q9H237	461 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	C19orf81	C9J6K1	198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FFAR3	O14843	346 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TRIM13	O60858	407 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	RGS3	P49796	1198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	STEAP3	Q658P3	488 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	DPP9	Q86TI2	863 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TRPV1	Q8NER1	839 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	DDX11	Q96FC9	970 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	NOX5	Q96PH1	765 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	IDI2	Q9BXS1	227 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	OTOF	Q9HC10	1997 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TADA3	O75528	432 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	INHBB	P09529	407 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM153B	P0C7A2	387 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	CSF2RA	P15509	400 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	BACE1	P56817	501 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM209A	Q5JX71	171 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ANO1	Q5XXA6	986 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	DPH6	Q7L8W6	267 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNC2	Q96PR1	638 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	SYT3	Q9BQG1	590 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	STRN	O43815	780 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	C8B	P07358	591 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	RARB	P10826	455 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ID4	P47928	161 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	GPR85	P60893	370 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	MIB1	Q86YT6	1006 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNJ15	Q99712	375 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	STK31	Q9BXU1	1019 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	IL23A	Q9NPF7	189 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	SNTG2	Q9NY99	539 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	TBX21	Q9UL17	535 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATXN3-223	ENST00000553686	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1B0GTL3	188 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	STAT5A	P42229	794 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	GRB14	Q14449	540 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	VWA3B	Q502W6	1294 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	EMC4	Q5J8M3	183 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATXN3-223	ENST00000553686	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		7.21	□□□□□ -1.26

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