RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 SOD2P04179 222 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PSMC3P17980 439 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 GDI1P31150 447 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 LIFRP42702 1097 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 HSD17B4P51659 736 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 IGBP1P78318 339 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 GHRHRQ02643 423 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SYT12Q8IV01 421 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TMTC2Q8N394 836 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 RNF169Q8NCN4 708 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.137e-8■■■□□ 18
CS-225ENST00000551253 NXPE2Q96DL1 559 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 LY9Q9HBG7 655 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SENP2Q9HC62 589 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ERAP1Q9NZ08 941 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 EBF1Q9UH73 591 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PI4KAP42356 2102 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 F8P00451 2351 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 FAM149AA5PLN7 773 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 OPLAHO14841 1288 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DDAH1O94760 285 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SLC11A1P49279 550 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SEMG2Q02383 582 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 KCNH2Q12809 1159 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 GRM4Q14833 912 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MAP3K14Q99558 947 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 APOL6Q9BWW8 343 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 AMNQ9BXJ7 453 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 A0A0U1RQF3 1178 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 CCDC69A6NI79 296 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ARNTLO00327 626 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TNFRSF10BO14763 440 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ZNF263O14978 683 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 CBFA2T3O75081 653 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 INSRRP14616 1297 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 FCARP24071 287 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MARK3P27448 753 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 PSMA5P28066 241 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 HOXA9P31269 272 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DPP6P42658 865 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TMPRSS3P57727 454 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 CATIPQ7Z7H3 387 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 FAM228AQ86W67 206 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 NAXDQ8IW45 347 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ZNF654Q8IZM8 581 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 STAG2Q8N3U4 1231 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 FBXL16Q8N461 479 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 ING5Q8WYH8 240 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 FGF11Q92914 225 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MTMR8Q96EF0 704 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 POLIQ9UNA4 740 aa8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-225ENST00000551253 TELO2Q9Y4R8 837 aa8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms