RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 USP20Q9Y2K6 914 aa18.77■□□□□ 0.6
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CS-214ENST00000548849 PRKCBP05771 671 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP18.76■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 MCM7P33993 719 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 FOXQ1Q9C009 403 aa18.76■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.76■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 PDXDC1Q6P996 788 aa18.75■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.75■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 NAB2Q15742 525 aa18.74■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 ERMNQ8TAM6 284 aa18.74■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 LRRN2O75325 713 aa18.73■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 GUCY1B3Q02153 619 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 POLD4Q9HCU8 107 aa18.73■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 KANSL1LA0AUZ9 987 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 B3GAT3O94766 335 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 EDN1P05305 212 aa18.72■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 NEK4P51957 841 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-214ENST00000548849 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
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CS-214ENST00000548849 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 PFKPQ01813 784 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 PRKCQQ04759 706 aa18.7■□□□□ 0.58
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CS-214ENST00000548849 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ING5Q8WYH8 240 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MTRRQ9UBK8 725 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 FAM170BA6NMN3 283 aa18.69■□□□□ 0.58
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CS-214ENST00000548849 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 RMDN1Q96DB5 314 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 UROC1Q96N76 676 aa18.69■□□□□ 0.58
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