RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 GNGT2O14610 69 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 IL1RL1Q01638 556 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NTRK3Q16288 839 aa20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MCF2P10911 925 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SLC1A1P43005 524 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MAPK7Q13164 816 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DNAJC3Q13217 504 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DNAJC6O75061 913 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SESTD1Q86VW0 696 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CASP2P42575 452 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SERPINB12Q96P63 405 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.5■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 REEP2Q9BRK0 252 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 VHLP40337 213 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 OSTNP61366 133 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 OCRLQ01968 901 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ACAD11Q709F0 780 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 LCA5Q86VQ0 697 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MTBPQ96DY7 904 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RGL1Q9NZL6 768 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF711Q9Y462 761 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 GNA15P30679 374 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 C7orf31Q8N865 590 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ABCB11O95342 1321 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KPNA7A9QM74 516 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ATP6V1G2O95670 118 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KRT7P08729 469 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 C16orf87Q6PH81 154 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.49■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ITGA8P53708 1063 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TFDP1Q14186 410 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TAF12Q16514 161 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 DENND3A2RUS2 1198 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 UBOX5O94941 541 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SKOR1P84550 965 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FSBPO95073 299 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MAGEA4P43358 317 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 MTMR8Q96EF0 704 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 THTPAQ9BU02 230 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 B2RBV5 119 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FBXL16Q8N461 479 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.48■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ESYT2A0FGR8 921 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 RPS6KA5O75582 802 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 AKR1B1P15121 316 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 CDHR1Q96JP9 859 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SBK1Q52WX2 424 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.47■□□□□ 0.87
SUDS3-204ENST00000543473 ZBBXA8MT70 800 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms