RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR16Q569H4 304 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCOA7Q8NI08 942 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL25Q9H293 177 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT122Q9HBG6 1241 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLK14Q9P0G3 267 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOTCH4Q99466 2003 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.41□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 86.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMCO2A6NFE2 343 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASTOR2A6NHX0 329 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E7EWF7 191 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN2P17706 415 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PON2Q15165 354 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLK5Q496M5 336 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR65Q8IYL9 337 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJA10Q969M2 543 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPB2Q96IY4 423 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB16Q96NS5 453 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K14Q99558 947 aa11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC69A6NI79 296 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PATE3B3GLJ2 98 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRG1P02750 347 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJA1P17302 382 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXA6P31267 233 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCR2P41597 374 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCAPQ12770 1279 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UVSSAQ2YD98 709 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YAF2Q8IY57 180 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNNM3Q8NE01 707 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMARCD2Q92925 531 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LNPKQ9C0E8 428 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INVSQ9Y283 1065 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.39□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCANO14594 1321 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR27A2RRH5 827 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERLIN2O94905 339 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF4AO95239 1232 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GBP1P32455 592 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP3B2Q13367 1082 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB33AQ14088 237 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELF2Q15723 593 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS36Q5K4E3 855 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA2G4FQ68DD2 849 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM143Q96AN5 459 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP89Q96ST8 783 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARP2Q9UGN5 583 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.38□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARNTLO00327 626 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAMTS3O15072 1205 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHOBTB1O94844 696 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPNS1P04632 268 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU2F2P09086 479 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPK8P45983 427 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARPP19P56211 112 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XKR3Q5GH77 459 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASC1Q6TDU7 716 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.37□□□□□ -0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms