RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529172.1

PPP6R3-216, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-216	ENST00000529172	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CPA4	Q9UI42	421 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RASA4B	C9J798	803 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RASA4	O43374	803 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FRS3	O43559	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	GPR32	O75388	356 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TCEA3	O75764	348 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SASH1	O94885	1247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KLHL18	O94889	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	GAST	P01350	101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	MYF5	P13349	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TYR	P14679	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	GYPE	P15421	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF28	P17035	718 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	DDC	P20711	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	MAL	P21145	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CRHR1	P34998	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SREBF1	P36956	1147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	DUSP2	Q05923	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KRT40	Q6A162	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172		Q6ZUG5	572 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	LPP	Q93052	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	APIP	Q96GX9	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KPNA5	O15131	536 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ITGA10	O75578	1167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KIT	P10721	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SLC7A1	P30825	629 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PTPN7	P35236	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PRIM2	P49643	509 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RRAD	P55042	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	TLE1	Q04724	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SSPN	Q14714	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	PHKB	Q93100	1093 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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