RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD1Q15327 319 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 UVSSAQ2YD98 709 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 KIAA2013Q8IYS2 634 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 RMDN1Q96DB5 314 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 C2orf40Q9H1Z8 148 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 PDZD7Q9H5P4 517 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 POLIQ9UNA4 740 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 POTEMA6NI47 508 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 WNT7AO00755 349 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 LRRN2O75325 713 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 RECQL4O94761 1208 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 PRKCQQ04759 706 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 RAB33AQ14088 237 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 NAB2Q15742 525 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 SLC44A4Q53GD3 710 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 RUBCNQ92622 972 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 NACC1Q96RE7 527 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 ARID2Q68CP9 1835 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 ACKR2O00590 384 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 POU2F2P09086 479 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 OR1D2P34982 312 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 MAPK6Q16659 721 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM132AQ24JP5 1023 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 RTL10Q7L3V2 364 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 ITFG1Q8TB96 612 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 SLC7A14Q8TBB6 771 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 BORCS6Q96GS4 357 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 HINFPQ9BQA5 517 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 BCO2Q9BYV7 579 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 CXCL16Q9H2A7 254 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 TUFT1Q9NNX1 390 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 PRKCBP05771 671 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 PFKPQ01813 784 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 NECAB1Q8N987 351 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 USP20Q9Y2K6 914 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRU-210ENST00000527027 FAM170BA6NMN3 283 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 KINO60870 393 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 MED24O75448 989 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 CYP11B2P19099 503 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 FGFR3P22607 806 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 UBXN2BQ14CS0 331 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF528Q3MIS6 628 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 DCLK2Q8N568 766 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 SUMF1Q8NBK3 374 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 DEPTORQ8TB45 409 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 BSNDQ8WZ55 320 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC113Q9H0I3 377 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 MTRRQ9UBK8 725 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 GPR179Q6PRD1 2367 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 CEP250Q9BV73 2442 aa17.76■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 LAMTOR5O43504 91 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 B3GAT3O94766 335 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 NEFLP07196 543 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 LIG1P18858 919 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 NAMPTP43490 491 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 ANAPC15P60006 121 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM29Q14134 588 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 ME3Q16798 604 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 PADI6Q6TGC4 694 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 NPAS3Q8IXF0 933 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 GTF3C6Q969F1 213 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 KXD1Q9BQD3 176 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 GDAQ9Y2T3 454 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 BACE2Q9Y5Z0 518 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 CDY1Q9Y6F8 540 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 TRAPPC3O43617 180 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRU-210ENST00000527027 EDN1P05305 212 aa17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms