RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-208	ENST00000526317	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	FSCN2	O14926	492 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	NR1I2	O75469	434 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CSPG5	O95196	566 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CXCL14	O95715	111 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ADRB2	P07550	413 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ACOT2	P49753	483 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	DPYD	Q12882	1025 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	STK4	Q13043	487 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TUSC3	Q13454	348 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	KYAT1	Q16773	422 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	SNX27	Q96L92	541 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TLR9	Q9NR96	1032 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TRANK1	O15050	2925 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CDH23	Q9H251	3354 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317		F8W810	466 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	EFEMP2	O95967	443 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CXCL8	P10145	99 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	GART	P22102	1010 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	SPAG1	Q07617	926 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TADA2A	O75478	443 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CTSA	P10619	480 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CLCNKB	P51801	687 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	HYAL1	Q12794	435 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	PNOC	Q13519	176 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	KCNB1	Q14721	858 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CD302	Q8IX05	232 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSRP1-208	ENST00000526317	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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