RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522638.1

IGKV3D-34-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 3D-34 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGKV3D-34, Length 302 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3D-34-201ENST00000522638 UBE2SQ16763 222 aa6.65□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.65□□□□□ -1.34
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.64□□□□□ -1.35
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 RAB33AQ14088 237 aa6.64□□□□□ -1.35
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 RTL10Q7L3V2 364 aa6.64□□□□□ -1.35
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CHFRQ96EP1 664 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZFP42Q96MM3 310 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SCLT1Q96NL6 688 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 HHIPQ96QV1 700 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CEP89Q96ST8 783 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.64□□□□□ -1.35
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.64□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MYLKQ15746 1914 aa6.64□□□□□ -1.35
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.63□□□□□ -1.35
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IGKV3D-34-201ENST00000522638 EBF1Q9UH73 591 aa6.63□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.63□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 LRRK2Q5S007 2527 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ZNF213O14771 459 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 MAP3K13O43283 966 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 WISP1O95388 367 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 OATP04181 439 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 PTPN2P17706 415 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 ITPKBP27987 946 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KIF5BP33176 963 aa6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
IGKV3D-34-201ENST00000522638 CAMK2BQ13554 666 aa6.62□□□□□ -1.35
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