RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 DNASE1L2Q92874 299 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 BRD9Q9H8M2 597 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.61□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 C4orf47A7E2U8 309 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 EXTL3O43909 919 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TSPAN1O60635 241 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 XYLBO75191 536 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 MOSPD3O75425 235 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TADA2AO75478 443 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 EPN2O95208 641 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 KIF4AO95239 1232 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 GDI1P31150 447 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 OR1D2P34982 312 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 LIFRP42702 1097 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CDC42EP1Q00587 391 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 NUCB1Q02818 461 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PSMD5Q16401 504 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 XKR3Q5GH77 459 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 KIAA1211LQ6NV74 962 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SLC5A5Q92911 643 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TTPALQ9BTX7 342 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 GDE1Q9NZC3 331 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.6□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CASTOR2A6NHX0 329 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 EML1O00423 815 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 PSMD10O75832 226 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CAPNS1P04632 268 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 POU2F2P09086 479 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 GJA1P17302 382 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CHMLP26374 656 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CDC27P30260 824 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CNR2P34972 360 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 DNM2P50570 870 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 RAB33AQ14088 237 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 AMHR2Q16671 573 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 RNF43Q68DV7 783 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CASC1Q6TDU7 716 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TTC8Q8TAM2 541 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 ASB16Q96NS5 453 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CCNC-211ENST00000521017 WDR27A2RRH5 827 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 ZBTB39O15060 712 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 B4GALT5O43286 388 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 PPP2R5DQ14738 602 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 IER2Q9BTL4 223 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 PTGESO14684 152 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 DCLK1O15075 740 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 GAS7O60861 476 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 HOXA6P31267 233 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 MCM5P33992 734 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 MPLP40238 635 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 NAB2Q15742 525 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 UVSSAQ2YD98 709 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 TMTC2Q8N394 836 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 RNF149Q8NC42 400 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 GAB3Q8WWW8 586 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 CCDC136Q96JN2 1154 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 TMEM87BQ96K49 555 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 RIT2Q99578 217 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 MTA3Q9BTC8 594 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 CSRNP2Q9H175 543 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 TRPV5Q9NQA5 729 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 SNTG2Q9NY99 539 aa11.57□□□□□ -0.56
CCNC-211ENST00000521017 KLK13Q9UKR3 277 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms