RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMP4Q99727 224 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WACQ9BTA9 647 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CASS4Q9NQ75 786 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRIT1Q9P2V4 623 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MSRAQ9UJ68 235 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLCA2Q9UQC9 943 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa1.63□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LATS1O95835 1130 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JMJD7P0C870 316 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WT1P19544 449 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCSHP23434 173 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MGAT1P26572 445 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM25P49756 843 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FLT3LGP49771 235 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VAV2P52735 878 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MANFP55145 182 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLRN1P58418 232 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSG1Q02413 1049 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FHL1Q13642 323 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC32Q14392 662 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C19orf54Q5BKX5 351 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTX3Q5HYI7 312 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARMC6Q6NXE6 501 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF66Q6ZN08 573 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q6ZVL8 140 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CKAP2LQ8IYA6 745 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HASPINQ8TF76 798 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX33Q8WV41 574 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHTF18Q8WVB6 975 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF428Q96B54 188 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KANSL2Q9H9L4 492 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPNE5Q9HCH3 593 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO34Q9NWN3 711 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERGEFQ9UGK8 458 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC23A1Q9UHI7 598 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRSS50Q9UI38 385 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNE5Q9UJ90 142 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EDARQ9UNE0 448 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF804BA4D1E1 1349 aa1.62□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VWC2LB2RUY7 222 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLD2O14939 933 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PJA2O43164 708 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OPA1O60313 960 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STK10O94804 968 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASLP04424 464 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKCGP05129 697 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR35P0CG20 571 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FPR1P21462 350 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SREBF1P36956 1147 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR15P49685 360 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAP2BP61225 183 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLFN5Q08AF3 891 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SQSTM1Q13501 440 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDB1Q16531 1140 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MST1LQ2TV78 715 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf27AQ580R0 203 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PITRM1Q5JRX3 1037 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKNAD1Q5T1N1 836 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSTD2Q5T7W7 516 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AWAT2Q6E213 333 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMBR1LQ6UX01 489 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTF1AQ7RTS3 328 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA3Q8NHX4 192 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP28Q8NHY6 868 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFAP2BQ92481 460 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCRL4Q96PJ5 515 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYOCQ99972 504 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ORAI3Q9BRQ5 295 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANO3Q9BYT9 981 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALNT9Q9HCQ5 603 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CABP5Q9NP86 173 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBCCD1Q9NVR7 557 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FLRT1Q9NZU1 646 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIRPGQ9P1W8 387 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTBD3Q9Y2F9 522 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa1.61□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01548A6NM66 108 aa1.6□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00473A8K010 186 aa1.6□□□□□ -2.15
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADM5C9JUS6 153 aa1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms