RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.47■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.47■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 RASA4BC9J798 803 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 RASA4O43374 803 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 MYBP10242 640 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 SUN2Q9UH99 717 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 ACADSBP45954 432 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 SERPINI1Q99574 410 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 SKIP12755 728 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 PNPLA4P41247 253 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 PRAMEP78395 509 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 TMPRSS15P98073 1019 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 NFIAQ12857 509 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 ART3Q13508 389 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 SLIT1O75093 1534 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 IQGAP1P46940 1657 aa18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1-202ENST00000517309 PMS2P54278 862 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TPI1P60174 286 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ACTR2P61160 394 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 OCRLQ01968 901 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR91A4D1P6 747 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 CTDNEP1O95476 244 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 LIG3P49916 1009 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ACER1Q8TDN7 264 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 GSTA4O15217 222 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 MAPK13O15264 365 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 MSH4O15457 936 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PDGFRAP16234 1089 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF677Q86XU0 584 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 KCNB2Q92953 911 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF3CO14782 793 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 HLA-DRAP01903 254 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 CXCL9Q07325 125 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 NUGGCQ68CJ6 796 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PID1Q7Z2X4 250 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ATL2Q8NHH9 583 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2Q2LH0YL09 131 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 GNGT2O14610 69 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PDLIM2Q96JY6 352 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 FGD4Q96M96 766 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 EPHX2P34913 555 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 COPS2P61201 443 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 TTC17Q96AE7 1141 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 NCK2O43639 380 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ACCSLQ4AC99 568 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 RUBCNQ92622 972 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 GBP5Q96PP8 586 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PITPNM3Q9BZ71 974 aa18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 STK25O00506 426 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PSMD3O43242 534 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 ALDH1A1P00352 501 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SREBF1P36956 1147 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 SULT1E1P49888 294 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 USP49Q70CQ1 688 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 YAF2Q8IY57 180 aa18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1-202ENST00000517309 PPM1NQ8N819 430 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms