RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 SPATA31D3P0C874 917 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ADRA1BP35368 520 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ID4P47928 161 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 USP14P54578 494 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 SESN3P58005 492 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 LCORLQ8N3X6 602 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ACAP3Q96P50 834 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TTC1Q99614 292 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TOR3AQ9H497 397 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 DPP7Q9UHL4 492 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 RPTORQ8N122 1335 aa6.2□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF185O15231 689 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ADCY6O43306 1168 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ENPP1P22413 925 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CRHR1P34998 444 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CDK17Q00537 523 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 STRN3Q13033 797 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 KIF27Q86VH2 1401 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ZEB2O60315 1214 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 PHF2O75151 1096 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 PTPN7P35236 360 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FLT3LGP49771 235 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TAP1Q03518 808 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 MST1LQ2TV78 715 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 RNF180Q86T96 592 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 RAX2Q96IS3 184 aa6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 COL4A3Q01955 1670 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 UNC119BA6NIH7 251 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 AKR1B10O60218 316 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 HLA-DOAP06340 250 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 BMPR1AP36894 532 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 GYS2P54840 703 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 GUCY1B3Q02153 619 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 UBR7Q8N806 425 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 REPS2Q8NFH8 660 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 EEA1Q15075 1411 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FANCAO15360 1455 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 AVPR1BP47901 424 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 HSPA2P54652 639 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.16□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 KIAA0556O60303 1618 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ZAR1LA6NP61 321 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CHN2P52757 468 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 RAP2BP61225 183 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 MXRA7P84157 204 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 CAVIN3Q969G5 261 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 NEU1Q99519 415 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 ADAM2Q99965 735 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 DKK2Q9UBU2 259 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 TBX22Q9Y458 520 aa6.15□□□□□ -1.42
RUFY3-215ENST00000515479 NEO1Q92859 1461 aa6.15□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 DISP1Q96F81 1524 aa6.15□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 PJA2O43164 708 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms