RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLMAPQ14BN4 828 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMED2Q15363 201 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM13CQ8NE31 585 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERMNQ8TAM6 284 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF653Q96CK0 615 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAAL1Q96ER3 474 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYT15Q9BQS2 421 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.31□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR91A4D1P6 747 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 PEX11AO75192 247 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADRB2P07550 413 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNB1P14635 433 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 GJC1P36383 396 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ECE1P42892 770 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SOX10P56693 466 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALCOCO2Q13137 446 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAF11Q15544 211 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 UCMAQ8WVF2 138 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 MKL1Q969V6 931 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 BPTFQ12830 3046 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 PASKQ96RG2 1323 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASA4BC9J798 803 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASA4O43374 803 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMD10O75832 226 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 AP1G2O75843 785 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFB10O96000 172 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SESN3P58005 492 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 OVGP1Q12889 678 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTFR1Q15390 333 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC1A5Q15758 541 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RFX8Q6ZV50 586 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC19Q9H756 370 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYH11P35749 1972 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.3□□□□□ -1.24
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RAPGEF6-211ENST00000512611 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC174Q6PII3 467 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO11Q86XK2 927 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNKSR1Q969H4 720 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERPINB12Q96P63 405 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 AMNQ9BXJ7 453 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.3□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 A6NHS1 94 aa7.29□□□□□ -1.24
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RAPGEF6-211ENST00000512611 K7ENM7 598 aa7.29□□□□□ -1.24
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RAPGEF6-211ENST00000512611 TPBGLP0DKB5 382 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RALAP11233 206 aa7.29□□□□□ -1.24
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RAPGEF6-211ENST00000512611 ADSSP30520 456 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF131P52739 623 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAD23BP54727 409 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RWDD2BP57060 319 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 SATB1Q01826 763 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 BLMHQ13867 455 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASA3Q14644 834 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNPTABQ3T906 1256 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.29□□□□□ -1.24
RAPGEF6-211ENST00000512611 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.29□□□□□ -1.24
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