RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLS3P13797 630 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL17P18621 184 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRM5P41594 1212 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP120Q8N960 986 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTPALQ9BTX7 342 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCND2Q9NZV8 630 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC26A4O43511 780 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTP2Q5QGT7 225 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KREMEN2Q8NCW0 462 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIMD1Q9UGP4 676 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USTQ9Y2C2 406 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCF2P10911 925 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BACH2Q9BYV9 841 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGM5O43548 720 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFPL2O75678 378 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B3GAT3O94766 335 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACAP3Q96P50 834 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1RP00736 705 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLCNKBP51801 687 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTMR3Q13615 1198 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMD5Q16401 504 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARSHQ5FYA8 562 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPBP1Q86WP2 473 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UROC1Q96N76 676 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIDD1Q9HB75 910 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASGR2P07307 311 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PROZP22891 400 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIN1Q05586 938 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDXDC1Q6P996 788 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LILRA6Q6PI73 481 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H0YCG3 227 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOM1L1O75674 476 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRD1O95696 1058 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLCG1P19174 1290 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBALD2Q8IYN6 164 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REEP2Q9BRK0 252 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLIC4Q9Y696 253 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABLIM1O14639 778 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAPPC3O43617 180 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM13AO94988 1023 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYT1P21579 422 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCM6Q14566 821 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UPP1Q16831 310 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XKR4Q5GH76 650 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZPBP2Q6X784 338 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXL6Q8N531 539 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYCT1Q8N699 235 aa25.52■■□□□ 1.68
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