RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	HLA-DOA	P06340	250 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RAP2B	P61225	183 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268		Q96MF0	132 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FEZ1	Q99689	392 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	VTA1	Q9NP79	307 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RNF181	Q9P0P0	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MAST3	O60307	1309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MGST3	O14880	152 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PJA2	O43164	708 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PDE8A	O60658	829 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	CDKL5	O76039	1030 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	CD38	P28907	300 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PLAA	Q9Y263	795 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SLC6A2	P23975	617 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	OCA2	Q04671	838 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MPP3	Q13368	585 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	AFMID	Q63HM1	303 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	UBR7	Q8N806	425 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MYOC	Q99972	504 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MRI1	Q9BV20	369 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268		A0A1B0GTW7	788 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ENPP1	P22413	925 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SREBF1	P36956	1147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PPP3CA	Q08209	521 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PHF2	O75151	1096 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	C1QL1	O75973	258 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MATN4	O95460	622 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FPR1	P21462	350 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FGFR4	P22455	802 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	DHCR24	Q15392	516 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ADRM1	Q16186	407 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RNF180	Q86T96	592 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	USP7	Q93009	1102 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	TLK1	Q9UKI8	766 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ZFPL1	O95159	310 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FDXR	P22570	491 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RARRES1	P49788	294 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268		Q6ZNX1	250 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RNF31	Q96EP0	1072 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-222	ENST00000498268	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	RAP2A	P10114	183 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	ALDH1A3	P47895	512 aa		5.15	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms