RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	TNFSF9	P41273	254 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	OR1G1	P47890	313 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	MARCH5	Q9NX47	278 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CLTA	P09496	248 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	DPYD	Q12882	1025 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TUSC3	Q13454	348 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	RABGGTA	Q92696	567 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM169	Q96HH4	297 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM206	Q9H813	350 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TLR9	Q9NR96	1032 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	ANK1	P16157	1881 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275		F8W810	466 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	FSCN2	O14926	492 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1	5e-9	■□□□□ 9.8
TTC3-223	ENST00000492275	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CNTN3	Q9P232	1028 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CXCL8	P10145	99 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	KCNE1	P15382	129 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	KYAT1	Q16773	422 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	EYS	Q5T1H1	3165 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TTC3-223	ENST00000492275	TTC26	A0AVF1	554 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ACOT2	P49753	483 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	STK4	Q13043	487 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	POSTN	Q15063	836 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	KANK3	Q6NY19	840 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	NR1I2	O75469	434 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	EFEMP2	O95967	443 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ADRB2	P07550	413 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	PSMD2	Q13200	908 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	TCF25	Q9BQ70	676 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	EXOC1	Q9NV70	894 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	REV3L	O60673	3130 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	LACTBL1	A8MY62	500 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	GART	P22102	1010 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	VPS52	Q8N1B4	723 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	TIGD1	Q96MW7	591 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	TGFB1I1	O43294	461 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	SPAG1	Q07617	926 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	HYAL1	Q12794	435 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	TMC7	Q7Z402	723 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ZBP1	Q9H171	429 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	UBE4B	O95155	1302 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	28.09	■■■□□ 2.09	5e-13	■■■■□ 20.3
TTC3-223	ENST00000492275	PNOC	Q13519	176 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB6	Q15916	424 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	SAAL1	Q96ER3	474 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TTC3-223	ENST00000492275	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		28.09	■■■□□ 2.09

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