RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489783.1

SHOC2-206, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, humanhuman

TSL 2

Gene SHOC2, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2-206ENST00000489783 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.8■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.8■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 GDE1Q9NZC3 331 aa24.8■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 SLC37A4O43826 429 aa24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 PMLP29590 882 aa24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 OR1D2P34982 312 aa24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 Q6ZUG5 572 aa24.79■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.79■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 FRYQ5TBA9 3013 aa24.78■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 MAN2B1O00754 1011 aa24.78■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 TUSC3Q13454 348 aa24.78■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 GRM2Q14416 872 aa24.78■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 XKR9Q5GH70 373 aa24.78■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 C4orf19Q8IY42 314 aa24.78■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.78■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 NID2Q14112 1375 aa24.78■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 M0R2N6 131 aa24.77■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 SATB1Q01826 763 aa24.77■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.77■■□□□ 1.56
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SHOC2-206ENST00000489783 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.77■■□□□ 1.56
SHOC2-206ENST00000489783 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.76■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 CCR3P51677 355 aa24.76■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 POU5F1BQ06416 359 aa24.76■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 CAPSQ13938 189 aa24.76■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.76■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.76■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 LXNQ9BS40 222 aa24.76■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 IER2Q9BTL4 223 aa24.75■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 NPY5RQ15761 445 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 FAM78AQ5JUQ0 283 aa24.74■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 BLIDQ8IZY5 108 aa24.74■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.73■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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SHOC2-206ENST00000489783 ARL2P36404 184 aa24.72■■□□□ 1.55
SHOC2-206ENST00000489783 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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