RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PANK4Q9NVE7 773 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.63□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 C2CD2LO14523 706 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 TBX10O75333 385 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 GCNT3O95395 438 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SOD2P04179 222 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 NUCB2P80303 420 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 MCL1Q07820 350 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 E2F4Q16254 413 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KYAT1Q16773 422 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SEZ6Q53EL9 994 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KCNN1Q92952 543 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 MARCH5Q9NX47 278 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CD207Q9UJ71 328 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.62□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 C5orf42Q9H799 3197 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 F8W810 466 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ABLIM1O14639 778 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PIGRP01833 764 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CLTAP09496 248 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KLRC2P26717 231 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 GLUD2P49448 558 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ASIC1P78348 528 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 USP41Q3LFD5 358 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 FUT10Q6P4F1 479 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 HASPINQ8TF76 798 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 HVCN1Q96D96 273 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SNX27Q96L92 541 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ACCSQ96QU6 501 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 FIZ1Q96SL8 496 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 IRAK3Q9Y616 596 aa14.61□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 OGTO15294 1046 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 GLP2RO95838 553 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ALCAMQ13740 583 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PTPN14Q15678 1187 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ADALQ6DHV7 355 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CASP10Q92851 521 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 UROC1Q96N76 676 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 TRIM9Q9C026 710 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CLEC1BQ9P126 229 aa14.6□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 A0A0B4J269 797 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 A0A1B0GVL5 298 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 B3GAT3O94766 335 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KIF4AO95239 1232 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CXCL8P10145 99 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 IL9P15248 144 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 KCNE1P15382 129 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CMA1P23946 247 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 AFMP43652 599 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 CLCNKBP51801 687 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL28-202ENST00000489442 COASYQ13057 564 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms