RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.56□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPPED1O15442 326 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 MMP13P45452 471 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 VAV2P52735 878 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASGRF1Q13972 1273 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 KAZNQ674X7 775 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 C7orf31Q8N865 590 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDOR1Q9UHB4 597 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.55□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDPK1O15530 556 aa4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PJA2O43164 708 aa4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNA6P17658 529 aa4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 TFF2Q03403 129 aa4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 FHL3Q13643 280 aa4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 TINF2Q9BSI4 451 aa4.54□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZMYM3Q14202 1370 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRSS44E7EML9 344 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRP2O60462 931 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAPK10P53779 464 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP2A13Q16696 494 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTERF2Q49AM1 385 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 GMLQ99445 158 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.53□□□□□ -1.68
CACNA2D1-211ENST00000486539 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 DVL2O14641 736 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT37O76014 449 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM153CQ494X1 144 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 NACC2Q96BF6 587 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCLYQ96I15 445 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.52□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 YY2O15391 372 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNQ2O43526 872 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOL3O95236 402 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPANK1O95872 356 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM153BP0C7A2 387 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSH3Q8TE77 659 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FERMT2Q96AC1 680 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS16Q9H269 839 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM260Q9NX78 707 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PADI4Q9UM07 663 aa4.51□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FGFR4P22455 802 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR15P49685 360 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRG3P56975 720 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLRN1P58418 232 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00205P59089 165 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF174Q15697 407 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYL10Q9BUA6 226 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.5□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYPNQ86TC9 1320 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PR48 441 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP6CO00743 305 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 GASTP01350 101 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 LMBR1LQ6UX01 489 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 MED25Q71SY5 747 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACRBPQ8NEB7 543 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.49□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 H7C1D1 291 aa4.48□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDH8O95206 1070 aa4.48□□□□□ -1.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
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