RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 EPHB4P54760 987 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NLRP5P59047 1200 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NR5A1Q13285 461 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 EPHA7Q15375 998 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GPR153Q6NV75 609 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NRCAMQ92823 1304 aa8.27□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ASGR1P07306 291 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 IQCEQ6IPM2 695 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TDP2O95551 362 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NR1D1P20393 614 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ACTR2P61160 394 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GUCY1B3Q02153 619 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 C14orf80Q86SX3 495 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CD302Q8IX05 232 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CAGE1Q8TC20 777 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 USP33Q8TEY7 942 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ZIM3Q96PE6 472 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CENPOQ9BU64 300 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 FAM205CA6NFA0 338 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 E7EVH7 732 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PFKMP08237 780 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF8P28908 595 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 HDAC4P56524 1084 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PHEXP78562 749 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TTC30AQ86WT1 665 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 DEFB118Q96PH6 123 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 GDF15Q99988 308 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 STRA6Q9BX79 667 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 RNF208Q9H0X6 261 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 KCND2Q9NZV8 630 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.26□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 C5orf60A6NFR6 353 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TEX33O43247 280 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 E2F6O75461 281 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 C22orf31O95567 290 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 PSEN2P49810 448 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ITIH3Q06033 890 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ADCY1Q08828 1119 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 ANO1Q5XXA6 986 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 MLKLQ8NB16 471 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TSC22D3Q99576 134 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 TIPINQ9BVW5 301 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 DACH1Q9UI36 760 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 WDR64B1ANS9 1081 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 KIF4AO95239 1232 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 RPA1P27694 616 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CYP4A11Q02928 519 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 CUL3Q13618 768 aa8.25□□□□□ -1.09
USP4-211ENST00000485450 SLC39A14Q15043 492 aa8.25□□□□□ -1.09
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