RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	SYP	P08247	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	AKR1A1	P14550	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	PFKL	P17858	780 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	GNA15	P30679	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	KCNJ6	P48051	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	PSMC6	P62333	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	CYP4F8	P98187	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	BEX3	Q00994	111 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	CHRND	Q07001	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB18-205	ENST00000484281	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	KCNJ4	P48050	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	KIF2C	Q99661	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	GP1BB	P13224	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PRKCA	P17252	672 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	DNAJB1	P25685	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RNF4	P78317	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CCNA1	P78396	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CSRP2	Q16527	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ASTN1	O14525	1302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	APC2	O95996	2303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	CLGN	O14967	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	PGK2	P07205	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	GYG1	P46976	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NRIP1	P48552	1158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	LIMK1	P53667	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	BACE1	P56817	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	GJA9	P57773	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NR1I3	Q14994	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB18-205	ENST00000484281	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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