RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482272.5

CTDSP1-208, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP1, Length 984 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-208ENST00000482272 TIPINQ9BVW5 301 aa14.78□□□□□ -0.04
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CTDSP1-208ENST00000482272 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1-208ENST00000482272 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDSP1-208ENST00000482272 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.78□□□□□ -0.04
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CTDSP1-208ENST00000482272 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 RTP2Q5QGT7 225 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 LILRA6Q6PI73 481 aa14.77□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.77□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MYO10Q9HD67 2058 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 RFPL2O75678 378 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 KIF4AO95239 1232 aa14.76□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 PSMD5Q16401 504 aa14.76□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 UROC1Q96N76 676 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 KCNK12Q9HB15 430 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 CLUHO75153 1309 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 SFI1A8K8P3 1242 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 TRAPPC3O43617 180 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 ZMYND10O75800 440 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 B3GAT3O94766 335 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PAPLNO95428 1278 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 GUCY2CP25092 1073 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 GRM5P41594 1212 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 SMTNP53814 917 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 STRN3Q13033 797 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 HYIQ5T013 277 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 CEP120Q8N960 986 aa14.75□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.051e-20■□□□□ 8.8
CTDSP1-208ENST00000482272 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 ABLIM1O14639 778 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 SLC16A4O15374 487 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MCF2P10911 925 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 OSTNP61366 133 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 GRIN1Q05586 938 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 LIN9Q5TKA1 542 aa14.74□□□□□ -0.05
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CTDSP1-208ENST00000482272 ACAP3Q96P50 834 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PLIN2Q99541 437 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 CDT1Q9H211 546 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 KCND2Q9NZV8 630 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 MYH11P35749 1972 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 PLS3P13797 630 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 FGFR3P22607 806 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 CLCN5P51795 746 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.73□□□□□ -0.05
CTDSP1-208ENST00000482272 TCF15Q12870 199 aa14.73□□□□□ -0.05
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