RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM127	O75204	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	C1QL1	O75973	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	PDCD1	Q15116	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	USP7	Q93009	1102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	NEMP1	O14524	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	LGALS4	P56470	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	STRN3	Q13033	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173		Q6ZNX1	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ENPP3	O14638	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ADCY6	O43306	1168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	BPI	P17213	487 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RARRES1	P49788	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	NHLH1	Q02575	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	UGT8	Q16880	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CTSS	P25774	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	FLT3LG	P49771	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CLRN1	P58418	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RAP2B	P61225	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	CDK17	Q00537	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	OCA2	Q04671	838 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	DHCR24	Q15392	516 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	MED25	Q71SY5	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF180	Q86T96	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	TTC1	Q99614	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCNL1-223	ENST00000481173	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCNL1-223	ENST00000481173	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCNL1-223	ENST00000481173	GAST	P01350	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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