RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 TMC2Q8TDI7 906 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 CCDC51Q96ER9 411 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PADI3Q9ULW8 664 aa28.12■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 NPTXRO95502 500 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 AFPP02771 609 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 TRIM49P0CI25 452 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 TRIM49CP0CI26 452 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 CD52P31358 61 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PBX1P40424 430 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PAK2Q13177 524 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 C1orf220Q5T0J3 134 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 VSTM4Q8IW00 320 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 BRSK2Q8IWQ3 736 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 HERVK_113Q902F9 699 aa28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PSMD6Q15008 389 aa28.1■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.1■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 CHST12Q9NRB3 414 aa28.1■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 STAG3L1P0CL83 205 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 WNT7BP56706 349 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 OSTNP61366 133 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 KYAT1Q16773 422 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 UBXN11Q5T124 520 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 USP37Q86T82 979 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 TMEM192Q8IY95 271 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 CCDC127Q96BQ5 260 aa28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 A0A1W2PQC6 194 aa28.08■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 NBNO60934 754 aa28.08■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 CLTAP09496 248 aa28.08■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.08■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 TET1Q8NFU7 2136 aa28.08■■■□□ 2.09
SOBP-202ENST00000477448 GRM5P41594 1212 aa28.08■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 DEFB123Q8N688 67 aa28.08■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 PPP1R9BQ96SB3 815 aa28.08■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 PDE11AQ9HCR9 933 aa28.08■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 RFC2P35250 354 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 FMO5P49326 533 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CLDN10P78369 228 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 PPP3CAQ08209 521 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 GPR153Q6NV75 609 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 DRC7Q8IY82 874 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 FAM161BQ96MY7 647 aa28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 ZBBXA8MT70 800 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CXCL8P10145 99 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 DLATP10515 647 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 PBX2P40425 430 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TCTN1Q2MV58 587 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TMC6Q7Z403 805 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SPC24Q8NBT2 197 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 FNBP1Q96RU3 617 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TMX1Q9H3N1 280 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 MMRN2Q9H8L6 949 aa28.06■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 PFKMP08237 780 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SYCP1Q15431 976 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CBWD6Q4V339 395 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CBWD3Q5JTY5 395 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 ACAP3Q96P50 834 aa28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 STX10O60499 249 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 GCLMP48507 274 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 KCNMA1Q12791 1236 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 DSC3Q14574 896 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SURF1Q15526 300 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 CGRRF1Q99675 332 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SNTG2Q9NY99 539 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.04■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 MGEA5O60502 916 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 IL18RAPO95256 599 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 GTF2H1P32780 548 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 FAM212AQ96EL1 285 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 HES2Q9Y543 173 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 IPPQ9Y573 584 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 PTPRJQ12913 1337 aa28.03■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms