RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477371.5

MRPL38-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L38, human

TSL 2

Gene MRPL38, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL38-208	ENST00000477371	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	NRP1	O14786	923 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CLIC2	O15247	247 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	OGT	O15294	1046 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	MYL1	P05976	194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ABCD1	P33897	745 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	IRS1	P35568	1242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	OR1G1	P47890	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	WNT7B	P56706	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	GRIK3	Q13003	919 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ALCAM	Q13740	583 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	NAB2	Q15742	525 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	P2RX5	Q93086	422 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CIT	O14578	2027 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ANK1	P16157	1881 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TH	P07101	528 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CLTA	P09496	248 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ERVFC1	P60507	584 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PSMD2	Q13200	908 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CAMK4	Q16566	473 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	IGSF21	Q96ID5	467 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	UBE4B	O95155	1302 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	ALDH2	P05091	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	GART	P22102	1010 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CYP2J2	P51589	502 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PLCB3	Q01970	1234 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TUSC3	Q13454	348 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KCNB1	Q14721	858 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TMEM169	Q96HH4	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	BIN1	O00499	593 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KIF4A	O95239	1232 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	SMC2	O95347	1197 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	NFIC	P08651	508 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	KCNE1	P15382	129 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PPM1A	P35813	382 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CLCNKB	P51801	687 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MRPL38-208	ENST00000477371	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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