RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 CXCR5P32302 372 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 EPHB4P54760 987 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CLDN10P78369 228 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TNFAIP2Q03169 654 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 MAPK6Q16659 721 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 GPR88Q9GZN0 384 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 H3BRB1 525 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 EVI5O60447 810 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 PRKCBP05771 671 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 H2AFZP0C0S5 128 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ZNF286BP0CG31 522 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 DGKDQ16760 1214 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 C8orf74Q6P047 294 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 H2AFVQ71UI9 128 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 METTL13Q8N6R0 699 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TAF4BQ92750 862 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CAVIN3Q969G5 261 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.55■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TOM1L1O75674 476 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 MYBL2P10244 700 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 GPC3P51654 580 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CLCN3P51790 818 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 POU5F1BQ06416 359 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 RPS6KA1Q15418 735 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 IFT20Q8IY31 132 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CLDN3O15551 220 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 RGS2P41220 211 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 IGBP1P78318 339 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SV2AQ7L0J3 742 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 FNBP1Q96RU3 617 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 GDF3Q9NR23 364 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.54■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 FTCDO95954 541 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ACOT2P49753 483 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 PTENP60484 403 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 NLRP4Q96MN2 994 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 FZD8Q9H461 694 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 RAB20Q9NX57 234 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.53■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ZMYND10O75800 440 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 KIF4AO95239 1232 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TM4SF4P48230 202 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ALS2CLQ60I27 953 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 SEMA4DQ92854 862 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 PSMB7Q99436 277 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.52■□□□□ 0.88
SYF2-204ENST00000476231 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.872e-7■□□□□ 11.1
SYF2-204ENST00000476231 ACKR2O00590 384 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ADCY6O43306 1168 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TMOD1P28289 359 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CRHR2Q13324 411 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 KIF22Q14807 665 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 USP38Q8NB14 1042 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 APBA2Q99767 749 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SYT11Q9BT88 431 aa20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 A6NJR5 290 aa20.51■□□□□ 0.87
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