RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CEP350	Q5VT06	3117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ADGRB2	O60241	1585 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PRX2	142 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ADAM17	P78536	824 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	GRM7	Q14831	915 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	GAGE13	Q4V321	117 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	RAX2	Q96IS3	184 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ING3	Q9NXR8	418 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	DPP7	Q9UHL4	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PR48	441 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	UBE2QL1	A1L167	161 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	GPR3	P46089	330 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ERVK-21	P61565	698 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	FOXL1	Q12952	345 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SPIDR	Q14159	915 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CNTD1	Q8N815	330 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	KLC2	Q9H0B6	622 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	STK26	Q9P289	416 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	NCDN	Q9UBB6	729 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SBF2	Q86WG5	1849 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD62	A6NC57	917 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF20	P17024	532 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	COMT	P21964	271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	EVA1C	P58658	441 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	CDK17	Q00537	523 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	HS1BP3	Q53T59	392 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	IL23A	Q9NPF7	189 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	JAG2	Q9Y219	1238 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RBM17-208	ENST00000467080	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080		K7ESF4	209 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	MTSS1	O43312	755 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	SELENOP	P49908	381 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	GUCY2F	P51841	1108 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	UBE3C	Q15386	1083 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	TOR2A	Q5JU69	321 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080		Q6ZSN1	163 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	TECPR2	O15040	1411 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ROCK1	Q13464	1354 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ADRB1	P08588	477 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	PTPRO	Q16827	1216 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	KCNK18	Q7Z418	384 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	TCF25	Q9BQ70	676 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	PEAK1	Q9H792	1746 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	PRAMEF4	O60810	478 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM127	O75204	238 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	CDSN	Q15517	529 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	MUM1	Q2TAK8	710 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	PALM2	Q8IXS6	379 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	D2HGDH	Q8N465	521 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	ADO	Q96SZ5	270 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM17-208	ENST00000467080	MENT	Q9BUN1	341 aa		7.25	□□□□□ -1.25

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