RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466159.6

SYNE1-217, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE1, Length 2,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-217ENST00000466159 NFASCO94856 1347 aa9.6□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 A6NNZ2 444 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 EBAG9O00559 213 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 NDUFAB1O14561 156 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 PPFIA2O75334 1257 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 ACOT2P49753 483 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 LIG4P49917 911 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 PRKG1Q13976 671 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CLUL1Q15846 466 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 C2CD6Q53TS8 623 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 FBXO25Q8TCJ0 367 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 C12orf42Q96LP6 360 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 C19orf81C9J6K1 198 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 FZD9O00144 591 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 TNNI1P19237 187 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CHRNA3P32297 505 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 KCNJ1P48048 391 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 SEC24CP53992 1094 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 RTP1P59025 263 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 GCNT1Q02742 428 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 EMC2Q15006 297 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 GNPTABQ3T906 1256 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 XKR3Q5GH77 459 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 MORC4Q8TE76 937 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 KLRG1Q96E93 195 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 CDHR1Q96JP9 859 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 TRIM7Q9C029 511 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 PTPRJQ12913 1337 aa9.59□□□□□ -0.87
SYNE1-217ENST00000466159 LCTP09848 1927 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ATP2A1O14983 1001 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 EXTL3O43909 919 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 RARAP10276 462 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 HSPA6P17066 643 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 CORO7P57737 925 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 CNTN2Q02246 1040 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 KRT71Q3SY84 523 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 EPN3Q9H201 632 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 HLA-DRAP01903 254 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 SHBGP04278 402 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 TMOD1P28289 359 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 RWDD2BP57060 319 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 BIRC3Q13489 604 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 PTGISQ16647 500 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ODF2Q5BJF6 829 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 FNBP1Q96RU3 617 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.57□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 CLDN3O15551 220 aa9.57□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 ERLIN2O94905 339 aa9.57□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 GGPS1O95749 300 aa9.57□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SYNE1-217ENST00000466159 CFHP08603 1231 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms