RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PTGES	O14684	152 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PIGR	P01833	764 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	BMP1	P13497	986 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	DSC1	Q08554	894 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	KCNA1	Q09470	495 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TUSC3	Q13454	348 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ALCAM	Q13740	583 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	UNC13D	Q70J99	1090 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	VPS52	Q8N1B4	723 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	HLA-C	Q95604	372 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		19.38	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TISP43	B9A030	160 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R37	O75864	691 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ZNF202	O95125	648 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CLTA	P09496	248 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	FAM212A	Q96EL1	285 aa		19.37	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902		A0A0B4J269	797 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	OGT	O15294	1046 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CXCL8	P10145	99 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TNFSF9	P41273	254 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	KYAT1	Q16773	422 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SNX27	Q96L92	541 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	STRA6	Q9BX79	667 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TLE6	Q9H808	572 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TMEM206	Q9H813	350 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	EXOC1	Q9NV70	894 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	NCOR1	O75376	2440 aa		19.36	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902		F8W810	466 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PER2	O15055	1255 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TADA2A	O75478	443 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CXCL14	O95715	111 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	NRIP1	P48552	1158 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	POSTN	Q15063	836 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	TNFRSF10A	O00220	468 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ACOT2	P49753	483 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	KCNQ1	P51787	676 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SPAG1	Q07617	926 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	HYAL1	Q12794	435 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	HASPIN	Q8TF76	798 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	MARCH5	Q9NX47	278 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	CLDND1	Q9NY35	253 aa		19.34	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	ANK1	P16157	1881 aa		19.33	■□□□□ 0.69
USP19-210	ENST00000465902	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	HIDE1	A8MVS5	230 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	C2CD2L	O14523	706 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FSCN2	O14926	492 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	MYL1	P05976	194 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CNTN3	Q9P232	1028 aa		19.33	■□□□□ 0.68

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