RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SEZ6Q53EL9 994 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 RABGGTAQ92696 567 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 HVCN1Q96D96 273 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PANK4Q9NVE7 773 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 IRAK3Q9Y616 596 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TCHHQ07283 1943 aa22.67■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 DLL1O00548 723 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 AMPD3Q01432 767 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PTPN14Q15678 1187 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CLUL1Q15846 466 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 XKR4Q5GH76 650 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 TRIM9Q9C026 710 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 A0A0C4DFX4 3053 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PPP1R37O75864 691 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 GCNT3O95395 438 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 URODP06132 367 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 FUT10Q6P4F1 479 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CLEC1BQ9P126 229 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CNTN3Q9P232 1028 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CD207Q9UJ71 328 aa22.65■■□□□ 1.22
VARS-218ENST00000459667 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TADA2AO75478 443 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KIF4AO95239 1232 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 EFEMP2O95967 443 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CLTAP09496 248 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 GLUD2P49448 558 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ASIC1P78348 528 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KYAT1Q16773 422 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ADALQ6DHV7 355 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.64■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 HASPINQ8TF76 798 aa22.64■■□□□ 1.21
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VARS-218ENST00000459667 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
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VARS-218ENST00000459667 KCNE1P15382 129 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 COASYQ13057 564 aa22.63■■□□□ 1.21
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VARS-218ENST00000459667 KCNC3Q14003 757 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 UROC1Q96N76 676 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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VARS-218ENST00000459667 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.63■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 A0A0B4J269 797 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TISP43B9A030 160 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 MYBP10242 640 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 PFKFB1P16118 471 aa22.62■■□□□ 1.21
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VARS-218ENST00000459667 TNFSF9P41273 254 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CASP5P51878 434 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 USP41Q3LFD5 358 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 ACCSQ96QU6 501 aa22.62■■□□□ 1.21
VARS-218ENST00000459667 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.62■■□□□ 1.21
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