RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 LMNAP02545 664 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 DCNP07585 359 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 POU2F2P09086 479 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 MCM7P33993 719 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 SPECC1Q5M775 1068 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 PADI6Q6TGC4 694 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 MTSS1LQ765P7 747 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 ERMNQ8TAM6 284 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 DEPTORQ8TB45 409 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 KCNG4Q8TDN1 519 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 BSNDQ8WZ55 320 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 FGF14Q92915 247 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 SHDQ96IW2 340 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 MYH15Q9Y2K3 1946 aa29.09■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 VWA8A3KMH1 1905 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 CYP11B2P19099 503 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 RPA1P27694 616 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 STARD6P59095 220 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 PPP2R5AQ15172 486 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 PARM1Q6UWI2 310 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 NOSTRINQ8IVI9 506 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 PJA1Q8NG27 643 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 DCHS1Q96JQ0 3298 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 DOCK6Q96HP0 2047 aa29.08■■■□□ 2.25
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 NTHL1P78549 312 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 RAB33AQ14088 237 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 FGF13Q92913 245 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 CXCL16Q9H2A7 254 aa29.07■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 CCL16O15467 120 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 GPC5P78333 572 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 UVSSAQ2YD98 709 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 RTL10Q7L3V2 364 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 C1orf210Q8IVY1 113 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 SLC7A14Q8TBB6 771 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 POLIQ9UNA4 740 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 R4GN57 208 aa29.06■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 ADAM12O43184 909 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 EDN1P05305 212 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 LIG1P18858 919 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 MUTP22033 750 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 FGFR3P22607 806 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 EEF1DP3Q658K8 133 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 GDAQ9Y2T3 454 aa29.05■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 OR52Z1P0C646 297 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 SP9P0CG40 484 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 EFNA5P52803 228 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 IFT74Q96LB3 600 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 FOXQ1Q9C009 403 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 MTRRQ9UBK8 725 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 USP20Q9Y2K6 914 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 MIA3Q5JRA6 1907 aa29.04■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 FANCMQ8IYD8 2048 aa29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 B3GAT3O94766 335 aa29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 OR1D2P34982 312 aa29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 ITFG1Q8TB96 612 aa29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 UROC1Q96N76 676 aa29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 KCNH3Q9ULD8 1083 aa29.03■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 GLULP15104 373 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 NEK4P51957 841 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 PFKPQ01813 784 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 PRKCQQ04759 706 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 KIFAP3Q92845 792 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF292O60281 2723 aa29.02■■■□□ 2.24
PBRM1-218ENST00000458294 KANSL1LA0AUZ9 987 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 TRAPPC3O43617 180 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 CLCNKBP51801 687 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 GLRA4Q5JXX5 417 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 ATF7IP2Q5U623 682 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 KIFC3Q9BVG8 833 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 CDY1Q9Y6F8 540 aa29.01■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 GUCY1B3Q02153 619 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 ST3GAL1Q11201 340 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF174Q15697 407 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 UPP1Q16831 310 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 ANKS3Q6ZW76 656 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 NPAS3Q8IXF0 933 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PBRM1-218ENST00000458294 NOTCH4Q99466 2003 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms