RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRF-209ENST00000438120 APRTP07741 180 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 FMO5P49326 533 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 GALCP54803 685 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRF-209ENST00000438120 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.12■□□□□ 0.49
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