RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CACNA1BQ00975 2339 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL4A3Q01955 1670 aa20.26■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTGESO14684 152 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADAM12O43184 909 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 THP07101 528 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 HOXA9P31269 272 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.25■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 WASF1Q92558 559 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 KXD1Q9BQD3 176 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNTG2Q9NY99 539 aa20.25■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 VWA8A3KMH1 1905 aa20.25■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 LAMTOR5O43504 91 aa20.24■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 RECQL4O94761 1208 aa20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 TXKP42681 527 aa20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRKCQQ04759 706 aa20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDXDC1Q6P996 788 aa20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM170BA6NMN3 283 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEMFO60524 1076 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CTDNEP1O95476 244 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PFKPQ01813 784 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNFRSF25Q93038 417 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 FZD8Q9H461 694 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PATJQ8NI35 1801 aa20.23■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 LIG1P18858 919 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP2B1P20020 1258 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD72P21854 359 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR1D2P34982 312 aa20.22■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM187BQ17R55 369 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.22■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCDNQ9UBB6 729 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOTCH4Q99466 2003 aa20.22■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACACBO00763 2458 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRKCBP05771 671 aa20.21■□□□□ 0.83
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UPK3BP1-201ENST00000428678 RAB33AQ14088 237 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 NAB2Q15742 525 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAPK6Q16659 721 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP20Q9Y2K6 914 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 GDAQ9Y2T3 454 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 F5P12259 2224 aa20.21■□□□□ 0.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 WNT7AO00755 349 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPTLC1O15269 473 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 FOSBP53539 338 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 UVSSAQ2YD98 709 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIP11Q15643 1979 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 BTBD18B2RXH4 712 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 B3GAT3O94766 335 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 POU2F2P09086 479 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 FGFR3P22607 806 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 DEPTORQ8TB45 409 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 BSNDQ8WZ55 320 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTMR9Q96QG7 549 aa20.19■□□□□ 0.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTRRQ9UBK8 725 aa20.19■□□□□ 0.82
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