RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 GNG11P61952 73 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CDC42EP1Q00587 391 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 POU5F1BQ06416 359 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CYP24A1Q07973 514 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PPFIA1Q13136 1202 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KRT39Q6A163 491 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZPBP2Q6X784 338 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1328Q86T90 577 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FNBP1Q96RU3 617 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MAP7D2Q96T17 732 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TCHPQ9BT92 498 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FLRT1Q9NZU1 646 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GJD2Q9UKL4 321 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 Q9Y3F1 56 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PARP14Q460N5 1801 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0B4J269 797 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ACKR2O00590 384 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CLDN3O15551 220 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 WIPF1O43516 503 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KRT86O43790 486 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZEB2O60315 1214 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KPNA6O60684 536 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZMYND10O75800 440 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ADRB2P07550 413 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MYL3P08590 195 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 AKR1A1P14550 325 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FERP16591 822 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CASQ1P31415 396 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PSMC4P43686 418 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KIF11P52732 1056 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PTENP60484 403 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 DLG4P78352 724 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PPP3CAQ08209 521 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 DRP2Q13474 957 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PSMD6Q15008 389 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SURF1Q15526 300 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GRIK4Q16099 956 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CCL14Q16627 93 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 AMHR2Q16671 573 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CBWD6Q4V339 395 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 IQCEQ6IPM2 695 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TLK2Q86UE8 772 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 VPS36Q86VN1 386 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF511Q8NB15 262 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CAPNS2Q96L46 248 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FAM81BQ96LP2 452 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 NLRP4Q96MN2 994 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SCLT1Q96NL6 688 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 STK33Q9BYT3 514 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SPC25Q9HBM1 224 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SIX2Q9NPC8 291 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 DNAI1Q9UI46 699 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 AKT3Q9Y243 479 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms