RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP37Q86T82 979 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA1524Q8TCG1 905 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM84AQ96KN4 292 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM39AQ9NV64 488 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNTG2Q9NY99 539 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TBX21Q9UL17 535 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 MGEA5O60502 916 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 NBNO60934 754 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLTBP09497 229 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYCP1Q15431 976 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCLYQ96I15 445 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACAP3Q96P50 834 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERGIC2Q96RQ1 377 aa30.05■■■□□ 2.4
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TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP2C18P33260 490 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLK7P49862 253 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADKP55263 362 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCL23P55773 120 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ENPEPQ07075 957 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CRACR2AQ9BSW2 395 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPRJQ12913 1337 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANK1P16157 1881 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNNI1P19237 187 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNMA1Q12791 1236 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC10A6Q3KNW5 377 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TC2NQ8N9U0 490 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF516Q92618 1163 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOL6Q9BWW8 343 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 IPPQ9Y573 584 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TANC1Q9C0D5 1861 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLDN10P78369 228 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 DSC3Q14574 896 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CPLX3Q8WVH0 158 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM117Q9H0C3 514 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM105AQ9NUU6 356 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 LACTBL1A8MY62 500 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 NRDCO43847 1150 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 GYPCP04921 128 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM14Q14142 442 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CGRRF1Q99675 332 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAM2Q99965 735 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF39Q9H2S5 420 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIK3Q9Y2K2 1263 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPM1P09493 284 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 AKAP5P24588 427 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYL7Q01449 175 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCN5AQ14524 2016 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 STX10O60499 249 aa30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CASP14P31944 242 aa30.01■■■□□ 2.39
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TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC112Q8NEF3 446 aa30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM8AQ9HCN3 771 aa30.01■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC26A0AVF1 554 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL18RAPO95256 599 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTF2H1P32780 548 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 MXI1P50539 228 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SURF1Q15526 300 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR5B17Q8NGF7 314 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CXCL16Q9H2A7 254 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CITO14578 2027 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFAP3LO75121 409 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RECQL4O94761 1208 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXOC3L4Q17RC7 722 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT39Q6A163 491 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 GBP6Q6ZN66 633 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SV2AQ7L0J3 742 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR49Q8IV35 697 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFCAB13Q8IY85 973 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARP2Q9UGN5 583 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC9A1P19634 815 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 YARSP54577 528 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 DBF4BQ8NFT6 615 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCNT4Q9P109 453 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM43BA6NCK2 446 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 APBA1Q02410 837 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 JADE1Q6IE81 842 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNGA4Q8IV77 575 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAIPQ9BWF2 469 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASB7Q9H672 318 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 P4HA2O15460 535 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PON1P27169 355 aa29.98■■■□□ 2.39
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