RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 STOML1Q9UBI4 398 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 L3MBTL1Q9Y468 752 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 VSNL1P62760 191 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RAD51Q06609 339 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CPB1P15086 417 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CCZ1BP86790 482 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 LCA5Q86VQ0 697 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NEMP1O14524 444 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC3O43617 180 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CXorf38Q8TB03 319 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ELP3Q9H9T3 547 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1CO00159 1063 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 VEPH1Q14D04 833 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ASIC4Q96FT7 647 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZFATQ9P243 1243 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JLW4 131 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 E5RI56 91 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 DIAPH2O60879 1101 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PDGFRAP16234 1089 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NLRP14Q86W24 1093 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.026e-9■□□□□ 8.6
CCSAP-203ENST00000366687 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 DPYSL4O14531 572 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RALAP11233 206 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RFC5P40937 340 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NAB2Q15742 525 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SNX19Q92543 992 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.41■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TTC23LQ6PF05 361 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 NCLNQ969V3 563 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 H0Y3Z8 333 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 CHUKO15111 745 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 KITP10721 976 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGDIAP52565 204 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PPP4CP60510 307 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF235Q14590 738 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TRIML2Q8N7C3 387 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 LCP1P13796 627 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 IMPG1Q17R60 797 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEF5Q92565 580 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 PDIA6Q15084 440 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA6Q8N139 1617 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SENP2Q9HC62 589 aa21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MYBP10242 640 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TROAPQ12815 778 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 EMC2Q15006 297 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC14Q15048 493 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 RNF217Q8TC41 542 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM132DQ14C87 1099 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 TC2NQ8N9U0 490 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 HACD3Q9P035 362 aa21.39■■□□□ 1.02
CCSAP-203ENST00000366687 F5H423 210 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 AP3B1O00203 1094 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 P4HA2O15460 535 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC22O60826 627 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TPI1P60174 286 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ITPK1Q13572 414 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.39■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CTDNEP1O95476 244 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 GH1P01241 217 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCEQ02156 737 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms