RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF585BQ52M93 769 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASAL3Q86YV0 1011 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 COLGALT2Q8IYK4 626 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNPOQ8N3V7 929 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASGRP4Q8TDF6 673 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFAP2BQ92481 460 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPRASP2Q96D09 838 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANAPC16Q96DE5 110 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNPEPQ9H4A4 650 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACTR10Q9NZ32 417 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERGEFQ9UGK8 458 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNE5Q9UJ90 142 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0A6YYJ9 748 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC12A8A0AV02 714 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00473A8K010 186 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRID2O43424 1007 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPANK1O95872 356 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGFR4P22455 802 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 WASP42768 502 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FNTBP49356 437 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 GUCY1A3Q02108 690 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PROSER3Q2NL68 480 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF8Q3BBV2 869 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC38Q5R3I4 469 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF329Q86UD4 541 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNGA4Q8IV77 575 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXL20Q96IG2 436 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMKK2Q96RR4 588 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZMYM3Q14202 1370 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRGV11A0A075B6L2 103 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TARM1B6A8C7 271 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC01565O15544 149 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBC1D4O60343 1298 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 OPHN1O60890 802 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERN1O75460 977 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGBP02675 491 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM191BP0C7N4 346 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAT1P18440 290 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 AZU1P20160 251 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP25P42331 645 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD11B2P80365 405 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FANCCQ00597 558 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD69Q07108 199 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TROAPQ12815 778 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYBPC3Q14896 1274 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q4G0T1 1027 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCE1CQ5T751 118 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 VWA1Q6PCB0 445 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAS1R1Q7RTX1 841 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CUZD1Q86UP6 607 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIGOQ8TEQ8 1089 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 SGSM3Q96HU1 749 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMLNQ96KR4 655 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIST1H2AJQ99878 128 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM55Q9BYV6 548 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTG2Q9H4K7 406 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF4Q9NR80 690 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 STRIP2Q9ULQ0 834 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TISP43B9A030 160 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADM5C9JUS6 153 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 LY86O95711 162 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLGP00747 810 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF6P49848 677 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRF9Q00978 393 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDR1Q08345 913 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FXNQ16595 210 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 GEN1Q17RS7 908 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXR2Q6PJQ5 311 aa1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms