RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 NAGPAQ9UK23 515 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 AKT3Q9Y243 479 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 KAT6AQ92794 2004 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 A0A087WZ62 844 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 B4GALT5O43286 388 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 VTNP04004 478 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TMOD1P28289 359 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 POU5F1BQ06416 359 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 HELQQ8TDG4 1101 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ANXA13P27216 316 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 MCL1Q07820 350 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZACNQ401N2 412 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TATDN2Q93075 761 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 SYT11Q9BT88 431 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 SETD4Q9NVD3 440 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PCNTO95613 3336 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ENC1O14682 589 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 MOCS3O95396 460 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC172P0C7W6 258 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PROZP22891 400 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIF22Q14807 665 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 NAB2Q15742 525 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 VPS36Q86VN1 386 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 KAT2BQ92831 832 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 NT5C1BQ96P26 610 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 NENFQ9UMX5 172 aa21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 OGTO15294 1046 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PHKA2P46019 1235 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYH10P35580 1976 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC66A2RUB6 948 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ERLIN1O75477 346 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TUBBP07437 444 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 L1RE1Q9UN81 338 aa21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 F2P00734 622 aa21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 MFAP3P55082 362 aa21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CGRRF1Q99675 332 aa21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TACC1O75410 805 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 HDXQ7Z353 690 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 BUB1O43683 1085 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 VNN1O95497 513 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 HLA-DRAP01903 254 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 USP8P40818 1118 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PSMC4P43686 418 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM187BQ17R55 369 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 TRIM58Q8NG06 486 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 SHC3Q92529 594 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 ABCB6Q9NP58 842 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms