RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SENP1Q9P0U3 644 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 TBX3O15119 743 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 ATF2P15336 505 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 STAT3P40763 770 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 CDR2Q01850 454 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 CBWD6Q4V339 395 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 PDP2Q9P2J9 529 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 UBE4BO95155 1302 aa20.59■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 CETPP11597 493 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 PSMC6P62333 389 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 MAML1Q92585 1016 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 JAG2Q9Y219 1238 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.58■□□□□ 0.89
NOP56-201ENST00000329276 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PDLIM1O00151 329 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 C2CD2LO14523 706 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZWINTO95229 277 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RCN2Q14257 317 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GSTA3Q16772 222 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZFP69BQ9UJL9 534 aa20.58■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CBX6O95503 412 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 POLE2P56282 527 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 DDB1Q16531 1140 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TRABD2AQ86V40 505 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CCDC22O60826 627 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZNF543Q08ER8 600 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 KCNA1Q09470 495 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TDRPQ86YL5 185 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CCDC125Q86Z20 511 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 UCMAQ8WVF2 138 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.57■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB5O15062 677 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 LRRN2O75325 713 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RSPH10BP0C881 870 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CHRNB2P17787 502 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 MEIS1O00470 390 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ATP9AO75110 1047 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TJP3O95049 919 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 KCNA3P22001 575 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 SLC34A1Q06495 639 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TMED2Q15363 201 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 FYB2Q5VWT5 728 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CYLDQ9NQC7 956 aa20.56■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CLDN3O15551 220 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CYP1A2P05177 515 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 CACNA2D1P54289 1103 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 TNIP1Q15025 636 aa20.55■□□□□ 0.88
NOP56-201ENST00000329276 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms