RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC43Q8N309 656 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RDH13Q8NBN7 331 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 FAM212AQ96EL1 285 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RMND1Q9NWS8 449 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ADRB2P07550 413 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GARTP22102 1010 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CASP4P49662 377 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 EPC2Q52LR7 807 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 XKR4Q5GH76 650 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 HACE1Q8IYU2 909 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ADSSL1Q8N142 457 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ANK1P16157 1881 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CSPG5O95196 566 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MBD3O95983 291 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CTNNB1P35222 781 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 BMPR1AP36894 532 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 SLC11A1P49279 550 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 GUCY2FP51841 1108 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 BCAR1P56945 870 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ERVK-21P61565 698 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 DSC1Q08554 894 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 URGCPQ8TCY9 931 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 MED15Q96RN5 788 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 DMAC2Q9NW81 257 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 CNTN3Q9P232 1028 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-201ENST00000309641 PDXKO00764 312 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 EXTL3O43909 919 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ITGB1P05556 798 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 THP07101 528 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GALTP07902 379 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 NFICP08651 508 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 STX17P56962 302 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 JADE1Q6IE81 842 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GPD1LQ8N335 351 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 FBXL18Q96ME1 805 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 PTPRJQ12913 1337 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 NRP1O14786 923 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 LPXNO60711 386 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 NR3C1P04150 777 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 KCNE1P15382 129 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJB1P25685 340 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 GRIK3Q13003 919 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ADGRE1Q14246 886 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 NFKBIBQ15653 356 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB6Q15916 424 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 CENPPQ6IPU0 288 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 DEFB123Q8N688 67 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-201ENST00000309641 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms