RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 EPAS1Q99814 870 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 STK33Q9BYT3 514 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 VPS11Q9H270 941 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 EVI5O60447 810 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CASP7P55210 303 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 NNTQ13423 1086 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 AMHR2Q16671 573 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PPM1NQ8N819 430 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 HPDLQ96IR7 371 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ABCB6Q9NP58 842 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PPME1Q9Y570 386 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ADGRB1O14514 1584 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 MED24O75448 989 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 VTNP04004 478 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CYBBP04839 570 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 TPI1P60174 286 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SYCP2LQ5T4T6 812 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 FGD4Q96M96 766 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 HACD3Q9P035 362 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 MYBL1P10243 752 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CCT5P48643 541 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SULT1E1P49888 294 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 POU5F1BQ06416 359 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 UBA3Q8TBC4 463 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 TTC17Q96AE7 1141 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CDCA5Q96FF9 252 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 AGAP3Q96P47 875 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.3□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CUL1Q13616 776 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 DYRK4Q9NR20 520 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ATP9BO43861 1147 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ITGB3P05106 788 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CLTAP09496 248 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 GALCP54803 685 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SESN3P58005 492 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ROR1Q01973 937 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SEC23AQ15436 765 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ARRDC4Q8NCT1 418 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 RDM1Q8NG50 284 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 BHMTQ93088 406 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 TBX20Q9UMR3 447 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 RTN2O75298 545 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 IRF1P10914 325 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 IL1RL1Q01638 556 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 OCRLQ01968 901 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PGBD3Q8N328 593 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 AK9Q5TCS8 1911 aa11.29□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ANO9A1A5B4 782 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 H3BRB1 525 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 IL18RAPO95256 599 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ALDH1A1P00352 501 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 SREBF1P36956 1147 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 NAGPAQ9UK23 515 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 CXCL11O14625 94 aa11.28□□□□□ -0.6
TMX3-201ENST00000299608 EXTL3O43909 919 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms