RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SYCE1LA8MT33 242 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 AP3B1O00203 1094 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ANP32DO95626 131 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 XKR3Q5GH77 459 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PID1Q7Z2X4 250 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TNIP3Q96KP6 325 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 GYPCP04921 128 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA33Q96N06 139 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NYAP2Q9P242 653 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.32■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ADORA2BP29275 332 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEF5Q92565 580 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 UNC13BO14795 1591 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CHN1P15882 459 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 USP49Q70CQ1 688 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KIF12Q96FN5 646 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FLT1P17948 1338 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM253P0C7T8 217 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PGM1P36871 562 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 HIC1Q14526 733 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.31■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP3O00186 592 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TMCC1O94876 653 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 E5RI56 91 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NME3Q13232 169 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SP110Q9HB58 689 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 P3H1Q32P28 736 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 STAT5BP51692 787 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 MTBPQ96DY7 904 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 HACD3Q9P035 362 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PRKCBP05771 671 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RNF149Q8NC42 400 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SMAPO00193 183 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NFIXQ14938 502 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B4P51659 736 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CDK17Q00537 523 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 EPAS1Q99814 870 aa22.29■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RNF217Q8TC41 542 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 P4HA2O15460 535 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 JAMLQ86YT9 394 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB9P50453 376 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms