RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261439.8

TBC1D1-201, Transcript of TBC1 domain family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBC1D1, Length 5,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D1-201ENST00000261439 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.37■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.37■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.37■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.37■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.37■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PALMDQ9NP74 551 aa15.37■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 KCNA2P16389 499 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ITIH2P19823 946 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ACTR2P61160 394 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PNKPQ96T60 521 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SLC1A1P43005 524 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SEMA3FQ13275 785 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 KYNUQ16719 465 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 EFHC2Q5JST6 749 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 GALNT4Q8N4A0 578 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PGBD4Q96DM1 585 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 STK33Q9BYT3 514 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MAGEB5Q9BZ81 275 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SAMD9Q5K651 1589 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TMEM94Q12767 1356 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 APRTP07741 180 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 STX3Q13277 289 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SIK2Q9H0K1 926 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 E2F8A0AVK6 867 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 F5H6K3 240 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM107AO95990 144 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SOX11P35716 441 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PHKA2P46019 1235 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FOXO4P98177 505 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 KLRC3Q07444 240 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MAPRE2Q15555 327 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ANO4Q32M45 955 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RHOBTB3O94955 611 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 COPB2P35606 906 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SERPINB4P48594 390 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TRIP10Q15642 601 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CD209Q9NNX6 404 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.36■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NLRP1Q9C000 1473 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CCDC78A2IDD5 438 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 KCNJ1P48048 391 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TRPC1P48995 793 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NUP93Q8N1F7 819 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 AGAP3Q96P47 875 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZNF609O15014 1411 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 B2RBV5 119 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 AKAP10O43572 662 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 EYA4O95677 639 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SLC9A1P19634 815 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PLA2G4AP47712 749 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CPA2P48052 419 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PSMC5P62195 406 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FEM1BQ9UK73 627 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MBD5Q9P267 1494 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 BTKQ06187 659 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 KRT33BQ14525 404 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 NAB2Q15742 525 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 LRRC31Q6UY01 552 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RFWD2Q8NHY2 731 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 EME1Q96AY2 570 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MTBPQ96DY7 904 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SGSM3Q96HU1 749 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 LMCD1Q9NZU5 365 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 LCP1P13796 627 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 IFNA8P32881 189 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 USP11P51784 963 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 FAM167AQ96KS9 214 aa15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TBC1D1-201ENST00000261439 MYMKA6NI61 221 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms