RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC42EP1Q00587 391 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 SURF1Q15526 300 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 NAB2Q15742 525 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ZACNQ401N2 412 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM58Q8NG06 486 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.31□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB20Q9NX57 234 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.31□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 CDC23Q9UJX2 597 aa10.31□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.31□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.31□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 FAM189A1O60320 539 aa10.3□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 MFAP3P55082 362 aa10.3□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 PPFIA1Q13136 1202 aa10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CRHR2Q13324 411 aa10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.3□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF410Q86VK4 478 aa10.3□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 TAS1R2Q8TE23 839 aa10.3□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 NT5C1BQ96P26 610 aa10.3□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 ACOT2P49753 483 aa10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 ARID5AQ03989 594 aa10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 KYAT1Q16773 422 aa10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 CEP112Q8N8E3 955 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF516Q92618 1163 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 NLRP4Q96MN2 994 aa10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 MAP7D2Q96T17 732 aa10.29□□□□□ -0.76
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APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 JRKLQ9Y4A0 524 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 NRCAMQ92823 1304 aa10.29□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa10.28□□□□□ -0.76
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