RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 APOL6Q9BWW8 343 aa9.63□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SEMA4GQ9NTN9 838 aa9.63□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 GDE1Q9NZC3 331 aa9.63□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NOTCH4Q99466 2003 aa9.63□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 F8W810 466 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CCL16O15467 120 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ASAP2O43150 1006 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TSPAN1O60635 241 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TADA2AO75478 443 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SHC2P98077 582 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 FGD1P98174 961 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TFDP1Q14186 410 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 EMC2Q15006 297 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LPAL2Q16609 132 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 Q4G0T1 1027 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 RTP2Q5QGT7 225 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ANO5Q75V66 913 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 RTL10Q7L3V2 364 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 RNF149Q8NC42 400 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CEP170P1Q96L14 293 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CSRNP2Q9H175 543 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ATRXP46100 2492 aa9.62□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 STBD1O95210 358 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PMLP29590 882 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CDC27P30260 824 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CNR2P34972 360 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LIMK1P53667 647 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NTHL1P78549 312 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TUSC3Q13454 348 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 KRT32Q14532 448 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NECTIN1Q15223 517 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 UVSSAQ2YD98 709 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 FERMT3Q86UX7 667 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ITFG1Q8TB96 612 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ING5Q8WYH8 240 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MSANTD3Q96H12 275 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 MTRQ99707 1265 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 BRD9Q9H8M2 597 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 HES2Q9Y543 173 aa9.61□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TDGF1P13385 188 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 NPEPPSP55786 919 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LRRC32Q14392 662 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ACAP1Q15027 740 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CEP57Q86XR8 500 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TBCKQ8TEA7 893 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 IRF7Q92985 503 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM143Q96AN5 459 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 ADAMTS3O15072 1205 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 KIF4AO95239 1232 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 TDP2O95551 362 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LRG1P02750 347 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 RHOP08100 348 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PTENP60484 403 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PPP2R5CQ13362 524 aa9.59□□□□□ -0.87
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