RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TUSC3Q13454 348 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TDGQ13569 410 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NAB2Q15742 525 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAPK6Q16659 721 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM187BQ17R55 369 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP41Q3LFD5 358 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LILRA6Q6PI73 481 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP57Q86XR8 500 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FLCNQ8NFG4 579 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYADMQ96S97 322 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIF2CQ99661 725 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FNIP2Q9P278 1114 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GDAQ9Y2T3 454 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COL4A3Q01955 1670 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PP2D1A8MPX8 630 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 E9PMD0 336 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACKR2O00590 384 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADAM12O43184 909 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PI15O43692 258 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PAPLNO95428 1278 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 THP07101 528 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CFHP08603 1231 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MUTP22033 750 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLCN5P51795 746 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUBP1P53384 320 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IL17AQ16552 155 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GPR65Q8IYL9 337 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CEP120Q8N960 986 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERMNQ8TAM6 284 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DEPTORQ8TB45 409 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STAMQ92783 540 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PIDD1Q9HB75 910 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DPP7Q9UHL4 492 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIOO75962 3097 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIP11Q15643 1979 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRBA1A5PL33 1030 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC169A6NNP5 214 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 I3L4J1 428 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 K7ERI5 159 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GFRA3O60609 400 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZMYND10O75800 440 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C1RP00736 705 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AOC1P19801 751 aa6.51□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms