RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PLS3	P13797	630 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PAM	P19021	973 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TESK2	Q96S53	571 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS45	Q9NRW7	570 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC1B	Q9P126	229 aa		5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	USP47	Q96K76	1375 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	AREL1	O15033	823 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	GSTA4	O15217	222 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	GFPT2	O94808	682 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ENPP1	P22413	925 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NR0B2	Q15466	257 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAM1	Q96QH2	718 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	GGA3	Q9NZ52	723 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	POGK	Q9P215	609 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	DCC	P43146	1447 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQY0	241 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NOTO	A8MTQ0	251 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS3	O15072	1205 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MGEA5	O60502	916 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TMCC2	O75069	709 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RAC2	P15153	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	AFM	P43652	599 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	STT3A	P46977	705 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK10	P53779	464 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	RTP1	P59025	263 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	IRF9	Q00978	393 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX17	Q15036	470 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF174	Q15697	407 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC14A2	Q15849	920 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP19	Q99542	508 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	STK26	Q9P289	416 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	EVC2	Q86UK5	1308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC12A8	A0AV02	714 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	TISP43	B9A030	160 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616		B9A039	149 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MAFK	O60675	156 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	MYF5	P13349	255 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	NCAM1	P13591	858 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE6A	P16499	860 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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