RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	BTBD11	A6QL63	1104 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ADCY6	O43306	1168 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SLC26A4	O43511	780 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FRS3	O43559	492 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	NUAK1	O60285	661 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	MGEA5	O60502	916 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	CTXN1	P60606	82 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PTH1R	Q03431	593 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SP8	Q8IXZ3	490 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TMX3	Q96JJ7	454 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538		A0A1B0GTL3	188 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538		A6NNZ2	444 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	DDC	P20711	480 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FLT3LG	P49771	235 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	GZMK	P49863	264 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SLURP1	P55000	103 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	NPEPPS	P55786	919 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	RAC3	P60763	192 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	RAB1A	P62820	205 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TLE1	Q04724	770 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	MTM1	Q13496	603 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FGL2	Q14314	439 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LGI4	Q8N135	537 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	IL17RA	Q96F46	866 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	IL23A	Q9NPF7	189 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	MYB	P10242	640 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TYR	P14679	529 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	MAL	P21145	153 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PTPN7	P35236	360 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	KCNC1	P48547	511 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ADAM8	P78325	824 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ATP8B2	P98198	1209 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LLGL1	Q15334	1064 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	VPS72	Q15906	364 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	KRT78	Q8N1N4	520 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PMM1	Q92871	262 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538		H3BUI4	141 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	APAF1	O14727	1248 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PMM2	O15305	246 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SASH1	O94885	1247 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	AMY1A	P04745	511 aa		5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
EP300-208	ENST00000635538	SYN1	P17600	705 aa		5.66	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms