RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 CHP1Q99653 195 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 INSL6Q9Y581 213 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TRANK1O15050 2925 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 LYPLA2O95372 231 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 RFC5P40937 340 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GPC3P51654 580 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP25P42331 645 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GIT2Q14161 759 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 YME1L1Q96TA2 773 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.44■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 DENND3A2RUS2 1198 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TADA3O75528 432 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EYA4O95677 639 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 MYLIPQ8WY64 445 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 NACC1Q96RE7 527 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.43■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 KRT83P78385 493 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ELF2Q15723 593 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 MNS1Q8NEH6 495 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TCP11Q8WWU5 503 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM143Q96AN5 459 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 CERS4Q9HA82 394 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 FAM228AQ86W67 206 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP4Q96MN2 994 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 A0A087WZ62 844 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 LCHNA4D1U4 455 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 KLK7P49862 253 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EMC2Q15006 297 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 KSR1Q8IVT5 923 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ADAM2Q99965 735 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0C4DFX4 3053 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0U1RQJ8 604 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 DGAT1O75907 488 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 RARRES1P49788 294 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TAP1Q03518 808 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 BMT2Q1RMZ1 405 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 REEP2Q9BRK0 252 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 CARD6Q9BX69 1037 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.4■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 FOSL2P15408 326 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GAP43P17677 238 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms